BER-IT wurde Ende Jahr 2003 als Beratungszentrum beim Träger Wirkstoff e.V. gegründet. 

Die Idee für eine Praxis- und Projektwerkstatt mit Coachingangeboten für Fachfrauen in IT-und Multimedia haben Susanne Thoma und Barbara Thiele 1999 entwickelt. Die erste Umsetzung erfolgte von 2000 bis 2002 als privatwirtschaftliche Initiative pepperpoint. Die erste Praxis- und Projektwerkstatt für Frauen in IT- und Multimedia existierte im Frauengewerbehof Weiberwirtschaft in Berlin. pepperpoint wurde von Berufs (wieder) einsteigerinnen mit unterschiedlicher und sich ergänzender fachlicher Kompetenz als Ort der Zusammenarbeit genutzt. pepperpoint bot preiswerte Räume und Arbeitsplätze für Produktionen oder die Erstellung von Referenzprojekten.

Ab 2005 wurde die Projektidee bei Wirkstoff e.V. unter dem Label "Talentschuppen" weiterentwickelt. Die damalige Senatsverwaltung für Wirtschaft, Arbeit und Frauen förderte in diesem Jahr den Aufbau der Infrastruktur der Projektwerkstatt. Seit 2006 ist das Angebot in das Beratungs- und Servicezentrum ber-IT integriert.

Zum Januar 2009 fusionierten die Vereine Wirkstoff e.V. und tech-teachers e.V. Seitdem ist die Trägerschaft von ber-IT beim Verein tech-teachers e.V. angesiedelt.